دخلت جامعة دمنهور نفق حالك الظلام لما تشهده من ارتباك وتخبط في إصدار القرارات التي تضر بالأمن الوطني وتقلد الإخوان المناصب الإدارية والقيادية بالجامعة ، حيث أصدر دكتور سعيد عبد الغني سرور القائم بتيسير أعمال الجامعة قرار بتعيين سمية فاروق محمود أمينا عاما لجامعة دمنهور خلفا لعواطف عبد المنعم وكانت سمية فاروق تعمل مديرا لمكتب الدكتور حاتم صلاح الدين رئيس الجامعة الأسبق ولديها ميول إخوانية ، كان سرور قد أصدر القرار دون استطلاع رأي الأمن الوطني ثم أصدر اخر باقالتها وتعيين احمد الهلي أمينا عاما للجامعة خلفاً والاستعانة بها في العلاقات العامة ولجنة تسير أعمال الجامعة مع مجموعة معروفة بميولها الإخوانية تشمل المستشار المالي لرئيس الجامعة ومدير مكتب رئيس الجامعة .

أثارت تلك القرارات حفيظة بعض الأساتذة والقيادات بالجامعة فتقدم د.محمد محمود داود المدرس بكلية التربية والمتحدث الرسمي باسم الجامعة باستقالته وكما تقدمت د.ايناس سعدة مدرس علم الاجتماع بكلية التربية استقالتها كمديرا للجودة وكذلك تقدم مصطفي عشري مدير الشؤون القانونية بجامعة كفر الشيخ والمنتدب للعمل بجامعة دمنهور طلب بالاعتذار عن إستكمال العمل ضمن تلك المنظومة .